8年8月的中法马江战役，是中ณ国近代海军组建以来对外的第一仗，却以福建水师几乎全军覆没惨告结束。海ร军的惨败，才使清廷开始重视海军建设。此前，海军展很不理想，除北洋海军外，其余南洋、福建、广东三支水师展极其缓慢。更重要且现在看来更难理解的是，全国竟然没有一个统一的海军指挥机关，各支水师皆由当地督抚管辖，本就很难协同作战，而各督抚更将水师看做是自己的私产，极难统一调遣。简单说，清廷仍是用管理传统水师方法管理近代海军，根本未意识到近代海ร军装备技术相当复杂，其管理难度远非传统水师可比，必须统一、系统管理。
收到李鸿章的奏折，清廷认为所甚有道理，便要他来京，与中枢各位大臣一同商议此事。9月0่日，清廷谕令军机大臣、总理衙门大臣会同李鸿章妥议海防事宜，醇亲王奕也一并与议。最后由á总理衙门复奏，提出设立海ร部或海防衙门，由特派王大臣综理其事。考虑到可供海ร战之船不多，决定暂时先从北洋已有船只精练海军一支，等到เ以后再考虑其他舰队。10月1้日，慈禧太后布懿旨，同意成立“总理海军事务衙门”简称“海军衙门”，由醇亲王奕为总理，庆郡王奕劻、李鸿章为会办，曾纪泽为帮办。
重大问题往往事关全局，所以应当全局讨论。
李、威会谈后，威妥玛一方แ面坚持离津南下上海，另一方面却又要求清政府正式委派全权大臣与他谈判，为ฦ“和谈”留下余地。威氏不久到烟台避暑，又通过赫德指名要李鸿章作为清政府全权代表到烟台与他谈判。在英方的威逼下，清政府于年月8日命令李鸿章到烟台与威妥玛会谈，李鸿章正式负责解决此事。李鸿章认为此事应迅了结，因为拖得越久，越易节外生枝，英方要价越高，而将岑毓英等提京审讯是威妥玛借以要挟的主要手段，因此主ว张提岑毓英来京与威妥玛面质。但总理衙门认为“此举ะ有碍中国体制，中国决不能ม允”，而其他方面均可让步。其实，这一年多的种种背景，已大体决定了谈判的结局，李鸿章也自知难有作为ฦ，所以大有进退两难之感。他在给沈葆桢的信中说英国可以对中国朝廷随意提要求，而他却不能随意对待他们，因为“稍不如愿，恐兵端随其后；若使其如愿，天下之恶皆归焉”。也就是说，如果不遂英方之愿，双方就可能开仗；如果满足英方要求，自己就要承担“天下之ใ恶”的罪名。在给总理衙门的信中，他表示原来希望能ม另派大员前往谈判，“今既ຂ奉旨ຈ专派，虽蹈汤火，岂敢固辞”，但他又大吐苦水：“将来筹办有未周到，不求局外原谅，不顾事后讥弹，幸同共济者尚能鉴其苦衷耳！”很明显，他深知谈判结果必定是屈服，会遭到国人痛责，他谨希望总理衙门和朝廷能体谅他的苦衷。另一方面，他这也是提醒总理衙门，谈判结局也有你们一份，责任要由大家共负。
如前所述，这时正是中国的西北、东南边境受到严重威แ胁的时候，因此听说马嘉理被杀，清政府大吃一惊，急忙向威妥玛表示将尽快通知云南当局进行调查。随后，上谕严å令岑毓英迅确查究办此案。对于威妥玛的六条要求，清政府断然拒绝。由于一时没有强有力的手段强迫中国就范，同时其他国家也反对英国单独扩大在华权益，威妥玛于是改变策略，集中要求实现前三条要求，并以与清政府断交相威胁。在他的威逼下，清政府开始妥协，原则上同意英方的前三条要求。由于当时只有上海ร可与伦敦通电å报，为便于与本国政府联系同时与柏郎到เ沪商议，威妥玛于年月初到เ达上海。为ฦ表示重视，清政府则在月19日任命李鸿章的哥哥、湖广总督李瀚章为ฦ钦差大臣，和前总理衙门大臣薛焕一同前往云南查办。采取退让和息事宁人的方针ฤ，是清政府对此案的基本态度，从曾国荃给其侄曾纪泽的一封信中可以看出当时的状：“京师城里以威妥玛拂衣出京，大家恐惧状，亦颇็露丑。”稍后介入此事的李鸿章采取委曲求全的态度，自不使人感到意外。
这就是当时清政府对海外华人的态度。历史的裂缝在“理”与“力”之间
华工的悲惨遭遇，引起了中外各界ศ的广泛关注和强烈愤怒。由á于允许华工出洋，清政府对华工的态度自然也有所转变，开始关注海外华工的生存状况。秘鲁是掳掠、虐待华工的主要国家之一。、9年总理衙门先后接到由美国公使转来的秘鲁华工求援禀文，曾有要施以援手的表示。李鸿章也早在0年就关注过海外各国虐待华工问题，曾建议总理衙门在日本长崎派员，兼充各港领事，以资联络邦交，保护华侨。年，李鸿章得知一艘拐运华工的秘鲁轮船在日本被扣后，立即愤怒地表示由于秘鲁与清政府并未建交，更无有关贩运华工条款，所以秘鲁贩运华工纯系非法，建议清政府派员赴日会审。
顽固派有的上奏朝廷，有的致函奕，想争取他而拆掉李鸿章的后台。为ฦ了耸人听闻，顽固派与前几次一样，先指责修路是“开辟所未有，祖宗所未创”，然后将修路与“灾异”联系起来，认为清宫太平门失火就是“天象示儆”。大体而，顽固派的意见集中ณ于以下几点：一、修铁路有利于外敌入侵。认为如修筑津通路，一旦外敌入侵即可经铁ກ路直达京师。二、修路扰民。铁ກ路所经之地，要拆毁民间田庐坟墓，必致民怨沸腾。三、修筑铁路夺民生计。铁ກ路修通后，将导致成千上万原来的水手、船夫、客店主贫困失业，断了他们的生计。
面对众多位高权重的大臣的强烈反对，李鸿章这次因有醇亲王支持，所以与顽固派针锋相对，反复辩驳，毫不示弱。对于铁ກ路“资敌”的责难，他反驳说敌人前来也必须用机车、车厢运兵，我方可先将机车、车厢撤回，使敌无车可乘๖；另外，到时还可以拆毁铁ກ轨或埋下地雷，使敌人不可能利用铁路长驱直入。相反，铁路将使中国运兵更加快捷。针对“扰民”观点，他以修筑唐山到大沽、大沽到เ天津的铁ກ路为例，认为修路应当尽量避免拆毁民间房屋坟墓，万一无法避免时，只要给居民以“重价”，民众就不反对修路。至于说到铁ກ路“夺民生计”，他认为更没有道理，从国外和国内已๐修通的铁ກ路沿线来看，铁路沿线生意达，修铁路、通火车只会增加各种职业。